При работе с данными филогенетического дерева в R (особенно при работе с объектами "phylo" или "phylo4") было бы полезно нормализовать длину ветвей, чтобы определенные таксоны (те, которые развиваются быстрее) не вносили непропорционально большую...

У меня есть 4000 записей объема в плантации деревьев. Мне нужно рассчитать Морана I для всей плантации. Я использую библиотеку ape , потому что spdep считается медленнее. Мой код таков: # Modified from...

Я новичок в Р. Я хотел бы использовать функцию R clustal в пакете ape для обработки моей последовательности ДНК, поэтому я могу использовать {pegas} для проведения дальнейшего анализа. Однако, когда я впервые пробую пример, приведенный в...

Я получаю сообщение об ошибке при использовании модели ARD функции ace в R. Ошибка Ошибка в float.pie.asp(XX[i], YY[i], pie[i, ], radius = xrad[i], col = piecol) : float.pie: значения x не должны быть отрицательными library(ape)...

Я знаю, как использовать результаты PCA для рисования круга , но не удалось нарисовать x.lab и y.lab на основе результатов построения из s.class . Как сделать сюжет, как я здесь разместил? Я хотел бы спросить об этом подробнее. Как...

Рассмотрим следующий набор данных: fictional.df <- data.frame(L1 = c(0,0,0,0,0,0,0,0), L2 = c(0,1,0,0,0,1,1,0), L3 = c(1,1,0,1,1,1,1,1), L4=c(0,0,1,1,0,0,0,0)) Я...