Я новичок в Perl, пожалуйста, помогите мне с моим запросом... Я пытаюсь извлечь информацию из таблицы blast (фрагмент того, как это выглядит ниже): Это стандартный ввод таблицы blast... I в основном хочу извлечь любую информацию из списка прочтений...

Я создал сценарий, который успешно ищет ключевые слова (указанные пользователем) в выходном файле Blastx в формате XML. Теперь мне нужно записать те записи (запрос, попадание, оценка, оценка и т. д.), которые содержат ключевое слово в заголовке...

Я хотел бы предварить этот пост, чтобы сказать, что я новичок в кодировании R и биоинформатики, и что я был бы очень признателен за некоторые комментарии от этого знающего сообщества. Моя цель для кода, размещенного ниже, состоит в том, чтобы создать...

В настоящее время я работаю над скриптом Python, и я застрял. Мой сценарий должен находиться на веб-странице , загрузить файл с компьютера, заполните форму, запустите действие (BLAST) и затем ждите, так как действие может быть долгим. (иногда...

Я начал свой проект с автономного NCBI BLAST и использовал параметр -outfmt 17. Для моей цели это форматирование чрезвычайно полезно. Однако мне пришлось перейти на Biopython, и теперь я использую qblast для согласования своих последовательностей с...

Я пытаюсь взорвать последовательность нуклеотидов, используя NCBIWWW from Bio.Blast import NCBIWWW my_query = "TGCGTGCCGTGCAATGTGCGT" result_handle = NCBIWWW.qblast("blastn", "nt", my_query) blast_result = open("my_blast.xml", "w")...