Вопросы по теме 'nlme'

Получение обобщенных средств наименьших квадратов для фиксированных эффектов в nlme или lme4
Средние наименьших квадратов с их стандартными ошибками для объекта aov можно получить с помощью функции model.tables : npk.aov <- aov(yield ~ block + N*P*K, npk) model.tables(npk.aov, "means", se = TRUE) Интересно, как получить...
3651 просмотров
schedule 09.06.2024

Что такое ошибка dimnames при оценке GLS?
Я немного погуглил и не могу найти документацию по этому поводу. Я пытаюсь оценить возможную модель обобщенных наименьших квадратов (FGLS) для данных временных рядов поперечного сечения в R. Например: library(nlme) foo <- gls(Y ~...
555 просмотров
schedule 30.03.2022

lme - Ошибка: объект типа «закрытие» не является подмножеством
Я пытаюсь запустить линейную модель со смешанными эффектами (пакет nlme), но постоянно получаю сообщение об ошибке: объект типа «закрытие» не является подмножеством. > apoeht <- read.csv("apoeht.csv") > library(nlme) > model.a...
5028 просмотров
schedule 08.04.2023

стандартная ошибка результата в lm и lme
У меня есть следующие линейные модели library(nlme) fm2 <- lme(distance ~ age + Sex, data = Orthodont, random = ~ 1) fm2.lm <- lm(distance ~ age + Sex,data = Orthodont) Как получить стандартную ошибку расстояния с учетом возраста и...
618 просмотров
schedule 06.11.2023

Просмотр примеров данных R через RPy (пример: lmeSplines)
В настоящее время я пытаюсь восстановить пример кода для lmeSplines (страницы 4 и 5 на официальная документация ). Первая строка кода (в синтаксисе R): # smoothing spline curve fit data(smSplineEx1) Как я могу просмотреть эти данные...
1674 просмотров
schedule 03.03.2023

Фактор уменьшения вдвое уменьшения шага сообщения об ошибке ниже минимального на шаге NLS: настройка nlsTols не работает
Я пытаюсь подогнать кривую логистического роста к некоторым данным с помощью функции gnls. Данные: structure(list(Nest = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 9L, 10L, 11L, 12L, 13L, 14L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L, 20L, 21L, 22L, 16L, 10L,...
17435 просмотров
schedule 22.09.2022

Объект gls, созданный с помощью функции-оболочки, не может быть предсказан с новыми данными
В следующем примере я использую функцию-оболочку для размещения объекта gls. Я могу успешно вернуть прогноз модели для исходных данных, но не при использовании newdata , который возвращает ошибку « Error in eval(expr, envir, enclos) : 'nthcdr' needs...
318 просмотров
schedule 24.03.2023

сохранить коэффициенты lmlist и остатки в набор данных
У меня есть 100 групп по 40 наблюдений в каждой. Я знаю, что могут быть и другие подходящие модели, но в настоящее время меня интересует только следующее. reg<-lmList(Y ~ Intercept + a + b + c + d | grp,data=data, pool=F) Чтобы сохранить...
861 просмотров
schedule 06.03.2023

Извлечение p-значений для фиксированных эффектов из вывода nlme / lme4
Я пытаюсь извлечь отдельные элементы (в частности, p-значения) из таблицы фиксированных эффектов, содержащейся в объекте, созданном сводным вызовом модели смешанных эффектов. Данные игрушек: set.seed(1234) score <- c(rnorm(8, 20, 3),...
5189 просмотров
schedule 01.05.2022

Проблема с моделью gls, сингулярная ошибка сходимости
Я хотел бы сделать модель gls, используя эти векторы: v1 <- c( 3.27985464, -0.40586830, -0.40586830, -0.09872472, -0.09872472, -0.40586830, -0.40586830, 0.82270601, -0.40586830, -0.40586830, -0.25229651, -0.40586830, -0.40586830, -0.40586830)...
578 просмотров
schedule 06.04.2022

Ошибка модели для нелинейной модели смешанных эффектов от Пиньеро и Бейтса
Я работал с Моделями смешанных эффектов в S и S-Plus Пиньеро и Бейтса и обнаружил много проблем, заставляющих работать модели из книги. Последним является использование функции постоянной плюс мощности для моделирования гетероскедастической...
127 просмотров
schedule 21.02.2024

Был ли plot.ACF удален из внешнего интерфейса NLME? Или я случайно изменил какие-то настройки?
Я использую R для анализа линейной модели смешанных эффектов (nlme::lme). Я хочу отобразить значения ACF пунктирной линией на альфа-уровне (как это делает plot.ACF). После того, как я require(nlme) , я могу запустить ACF, но plot.ACF по-прежнему...
78 просмотров
schedule 09.07.2022

Как включить продольный эффект в линейную модель смешанного эффекта
Мне нужно ОЦЕНИТЬ ПРОДОЛЬНОЕ ИЗМЕНЕНИЕ ЖИРА МЕЖДУ 2 ПОСЕЩЕНИЯМИ с помощью линейной модели смешанных эффектов. У меня есть некоторые, которые будут меняться от визита 1 к визиту 2, так как это статус гипертонии, статус диабета, ИМТ, окружность...
121 просмотров
schedule 21.12.2022

Графики остатков модели смешанных эффектов с использованием функции ggplot2
Я пытаюсь построить график остаточных эффектов модели смешанных эффектов, используя функцию ggplot2. Однако после выполнения поиска я нашел некоторые доступные функции, но мне кажется, что для функции nlme они не работают. Графики, которые я...
71 просмотров
schedule 08.01.2023