Вопросы по теме 'rna-seq'
как создать узлы и ребра для списка генов сорго, используя идентификатор гена из Phytozome
Я использую Sorghum ID от Phytozome в своем RNAseq. Я хочу создать генную сеть с помощью цитоскейпа для определенного списка генов. К сожалению, я не мог использовать строку или другие инструменты, потому что идентификатор гена, который я...
28 просмотров
schedule
25.12.2023
Изменить порядок условий при построении нормализованного счета для одного гена
У меня есть df из 17 переменных (мои образцы) с расположением условия, которое я хотел бы построить на основе одного гена «белок фотосистемы II D1 1»
View(metadata)
sample location
<chr> <chr>
1 X1344 West
2 X1345 West...
33 просмотров
schedule
23.08.2023
Snakemake --forceall --dag приводит к ошибке мистериуса: ‹stdin›: синтаксическая ошибка в строке 1 рядом с «Файл» из Graphvis
Мои попытки построить DAG или граф правил из конвейера RNA-seq с использованием snakemake приводят к сообщению об ошибке от graphviz. 'Ошибка:: синтаксическая ошибка в строке 1 рядом с' Файл '.
Ошибку можно исправить, закомментировав две команды...
579 просмотров
schedule
13.05.2022