Вопросы по теме 'rna-seq'

как создать узлы и ребра для списка генов сорго, используя идентификатор гена из Phytozome
Я использую Sorghum ID от Phytozome в своем RNAseq. Я хочу создать генную сеть с помощью цитоскейпа для определенного списка генов. К сожалению, я не мог использовать строку или другие инструменты, потому что идентификатор гена, который я...
28 просмотров
schedule 25.12.2023

Изменить порядок условий при построении нормализованного счета для одного гена
У меня есть df из 17 переменных (мои образцы) с расположением условия, которое я хотел бы построить на основе одного гена «белок фотосистемы II D1 1» View(metadata) sample location <chr> <chr> 1 X1344 West 2 X1345 West...
33 просмотров
schedule 23.08.2023

Snakemake --forceall --dag приводит к ошибке мистериуса: ‹stdin›: синтаксическая ошибка в строке 1 рядом с «Файл» из Graphvis
Мои попытки построить DAG или граф правил из конвейера RNA-seq с использованием snakemake приводят к сообщению об ошибке от graphviz. 'Ошибка:: синтаксическая ошибка в строке 1 рядом с' Файл '. Ошибку можно исправить, закомментировав две команды...
579 просмотров
schedule 13.05.2022