Вопросы по теме 'spatstat'
Как убедиться, что многоугольник в spatstat :: owin (poly = ‹polygon›) не имеет отрицательной области
Я новый пользователь пакета R spatstat, и у меня возникли проблемы с созданием многоугольного окна наблюдения с помощью owin (). Код следующий:
library("maps")
library ("sp")`
library("spatstat")
mass.map <- map("state", "massachusetts:main",...
2429 просмотров
schedule
10.10.2023
spatstat wiht R: Ошибка определения окна пространственного точечного массива
См. Изображение ниже. Это изображение создается путем преобразования фрейма данных с двумя столбцами в окно исследования (назовите его study_win) с помощью as.owin, а затем построения другого фрейма данных с двумя столбцами (назовите его...
1023 просмотров
schedule
10.06.2022
Как Adaptive.de density () (spatstat) управляет дублированными точками и значением f по умолчанию
Я не могу найти эту информацию в справочной литературе [1]
1) как Adaptive.de density () (пакет spatstat) управляет дублированными пространственными точками. Я продублировал точки точно в одном и том же положении, потому что я комбинирую...
71 просмотров
schedule
05.06.2023
Преобразование PPP в multitype
Я обработал два немаркированных набора данных плоских точечных шаблонов с помощью серии функций spatstat. Теперь я хотел бы использовать функцию Kcross.inhom для описания взаимодействия между ними, но Kcross работает только с помеченными данными,...
1208 просмотров
schedule
14.09.2022
Постройте остатки в spatstat без наложения точек
Это может быть очень просто, но я потратил довольно много времени, пытаясь понять это без особой удачи, может быть, кто-нибудь сможет мне помочь.
У меня есть модель точечного паттерна, подогнанная с помощью функции ppm () в spatstat...
116 просмотров
schedule
11.04.2022
Как бороться с временной корреляцией / трендом в миллионных долях в минуту
Добрый день,
Я работал с Baddeley et al. 2015 , чтобы подогнать модель точечного процесса к нескольким точечным образцам с помощью mppm {spatstat} . Мои точечные шаблоны - это годовые данные о количестве крупных травоядных (то есть точечные...
146 просмотров
schedule
28.04.2023
ошибка функции кредитного плеча: количество заменяемых элементов не кратно длине замены
У меня возникли проблемы при попытке построить график кредитного плеча для модели точечного паттерна в spatstat . Это странно, потому что вчера он отлично работал с той же моделью, а теперь - нет.
У меня есть модель с 3 ковариатами и...
56 просмотров
schedule
11.05.2022
Сеть не подключена - пакет spatstat в R
Я изучаю spatstat на R. В качестве первого шага я конвертирую свой шейп-файл, чтобы он подходил для алгоритмов spatstat. Когда я использую as.linnet для преобразования в линейную сеть (последняя строка в приведенном ниже коде), я получаю...
58 просмотров
schedule
19.05.2022
Необходимо указать значение ковариаты «x» (в качестве аргумента для функции effectfun).
Я читаю текст из учебника spatstat и пытаюсь изучить соответствие модели с помощью ppm. Я создал модель с картографическими координатами в качестве ковариант. Затем я хотел увидеть влияние только одной ковариаты на модель,
model1 =...
54 просмотров
schedule
18.10.2023
как удалить одинаковые точки из разных точечных шаблонов
У меня есть два наблюдаемых точечных шаблона в сети: obs1 и obs2 . Эти точки наблюдаются и заносятся в журнал полевых измерений. Некоторые из них (скажем, s ) всегда находятся в одном и том же месте. То есть s является общим для obs1 и...
32 просмотров
schedule
15.05.2022
как контролировать прозрачность графика плотности ppp
Я пытаюсь использовать многоуровневые методы для наложения нескольких пространственных объектов spatstat. Все эти объекты предназначены для одного окна. Имею im слой (плотность) из ппп. Я хочу сделать этот слой немного прозрачным, чтобы лучше...
245 просмотров
schedule
31.03.2022
Выборка изображения для получения точечного рисунка
Вот пример, когда авторы сделали это изображение:
и проанализированы с помощью spatstat. Для этого они извлекли координаты, как их можно было увидеть здесь . Я хотел бы сделать то же самое, и мне интересно, как можно получить образец...
393 просмотров
schedule
08.01.2023
Как получить область для ограничивающей рамки для каждой точки в данных плоского точечного массива (ppp) с помощью Spatstat в R?
У меня есть объект точечного шаблона (ppp), то есть набор данных, содержащий географические координаты определенных позиций. Например:
> data(bei)
> df1<-as.data.frame(bei)
> View(df1)
> head(df1)
x y
1 11.7 151.1
2...
318 просмотров
schedule
19.04.2024
прогнозы модели spatstat для нового набора данных
У меня есть модель, как показано ниже,
fit <- ppm(dat.ppp, trend = ~ tpo + sbd + water + nitro + roaden + hpop + temp + elev)
Я хочу предсказать новый набор данных с теми же именами ковариант с разными значениями, называемыми newdata, как...
52 просмотров
schedule
19.06.2022
как установить диапазоны координат X и Y для геометрии окна наблюдения в пакете spatstat в R
Привет? У меня есть данные о распространении саженцев, которые содержат типы видов, координаты X и Y в UTM. Я хочу создать точечный узор по их координатам X и Y с помощью функции ppp () в пакете spatstat. Я попробовал это двумя способами:...
239 просмотров
schedule
21.03.2023
Как я могу создать объект linnet, начиная с объекта sf с геометрическим столбцом LINESTRING?
В настоящий момент я работаю над проектом с событиями точечных паттернов в линейной сети (автомобильные аварии) и читаю главу 17 spatstat книги: «Пространственные точечные паттерны: методология и приложения с R».
Авторы книги объясняют, что они...
213 просмотров
schedule
20.03.2024
Как объединить несколько объектов ppp
Я не уверен, что это значимый вопрос, но я не понимаю, как (и если) можно объединить список объектов ppp в уникальный объект ppp . Например
library(spatstat)
#> Loading required package: spatstat.data
#> Loading required package: nlme...
192 просмотров
schedule
12.08.2023
Как приспособить процесс насыщения Гейера для взаимодействия между метками?
У меня есть два типа меток в моем точечном паттерне, и я хочу изучить взаимодействие между ними. Я не уверен, привлекательны они или отталкивающи, поэтому я хочу попробовать подобрать Geyer, а не MultiStrauss. Насколько я понимаю, Hybrid дает разные...
28 просмотров
schedule
05.05.2023
Коррекция артефактов в spatstat для точечных паттернов биологических клеток
Я использую spatstat для анализа биологических клеток (зависимостей, взаимодействий и т. Д.) С их центрами для создания точечных паттернов. Однако я понимаю, что артефакт вызван их размерами в 2D. Как лучше всего исправить такие артефакты при...
17 просмотров
schedule
26.10.2022
Указание пользовательских весов для непараметрической оценки пространственно изменяющегося относительного риска в spatstat
Есть ли способ указать веса в relrisk.ppp функции в spatstat (версия 1.63-3)?
Функция relrisk.ppp вызывает функцию density.ppp , которая позволяет пользователям указывать свои собственные веса.
Например, давайте построим на...
51 просмотров
schedule
21.12.2023
