Публикации по теме 'survival-analysis'
Анализ выживания (II): смоделированные данные с точки зрения машинного обучения
1. Введение
Анализ выживания — это статистический метод, который обычно используется в бизнесе и микроэкономике для анализа времени событий или сбоев, что может помочь в принятии решений и оптимизации распределения ресурсов. Вот некоторые примеры:
Отток клиентов. Анализ выживаемости можно использовать для прогнозирования того, когда клиент, скорее всего, перестанет использовать продукт или услугу, или «отток». Эта информация может помочь компаниям разработать целевые стратегии..
Анализ выживания: оптимизируйте частичное правдоподобие модели Кокса
Нахождение коэффициентов, которые максимизируют частичное логарифмическое правдоподобие в Python
Оглавление
"Введение" Модель пропорциональных рисков Кокса Задача оптимизации "Выполнение" Выводы "Использованная литература"
1. Введение
Анализ выживания включает в себя набор статистических методов для описания времени до данных о событии.
В этом посте мы представляем популярный алгоритм анализа выживания — модель пропорциональных рисков Кокса¹. Затем мы определяем..
Вопросы по теме 'survival-analysis'
Прогноз с помощью survreg/tobit выходит за границы
Поэтому я использую survreg и ожидаю, что мои прогнозируемые результаты будут соответствовать нижней границе 0, но они часто указывают на отрицательные результаты. Я думаю, что это каким-то образом оценивает линейный результат, а не модель выживания,...
1303 просмотров
schedule
08.03.2024
Knitr: survplot в цикле не создаются при следовании за другим survplot.
Ниже приведен минимальный пример:
\documentclass{article}
\begin{document}
<<data, results='hide', echo=FALSE, include=FALSE>>=
library(rms)
fake.survival.data <- Surv(1:30, rep(1, 30))
fit <- survfit(fake.survival.data ~ 1)...
165 просмотров
schedule
23.05.2024
Изменение цвета символа на графике Р Каплана Мейера?
Возможно, глупый вопрос, но как изменить символ или цвет метки на графике Каплана Мейера? Я знаю, что в lines.survfit есть возможность изменить фактический символ метки, но, по-видимому, не цвет символа (только цвет линии).
Я попытался вручную...
2015 просмотров
schedule
17.03.2023
Объект R типа «среда» не является подмножеством
Я делаю анализ выживаемости с интервальными цензурированными данными и пытаюсь использовать функцию intcox() из пакета incox для выполнения регрессии Кокса. Я уже провел часть анализа с помощью survfit(), и все работало нормально.
Когда я пытаюсь...
5422 просмотров
schedule
27.03.2024
Запуск подмножества модели Dredge из clogit
Я пытаюсь запустить драгу на моей полной модели clogit (из пакета survival ), но R продолжает падать каждый раз, когда я пытаюсь это сделать. Я просто получаю сообщение об ошибке: «R обнаружил фатальную ошибку. Сеанс был прерван»....
400 просмотров
schedule
10.11.2023
R рисовать несколько моделей на одном графике
Я сделал несколько моделей выживания, используя подход Каплана-Меира, каждая модель выживания была построена путем извлечения подмножества данных в другую таблицу данных R на основе группового столбца, показанного в таблице данных. Я могу построить...
1694 просмотров
schedule
21.07.2022
R Легенда графика выживания
У меня есть таблица, которая выглядит так:
ID Survival Event Allele
2 5 1 WildType
2 0 1 WildType
3 3 1 WildType
4 38 0 Variant
Я хочу составить заговор каплан-мейера и сказать мне, имеют ли дикие разновидности или...
1572 просмотров
schedule
02.05.2023
fminsearch подвергнут цензуре MATLAB
РЕДАКТИРОВАТЬ Я обнаружил, что y(c) в моем скрипте дает эту ошибку:
Subscript indices must either be real positive integers or logicals.
но в примере сценария y(c) печатает цензурированные значения y.
Я пытаюсь использовать скрипт, который...
114 просмотров
schedule
12.10.2023
Ожидается тип функции R predict.cox
Я использую модель Кокса для прогнозирования.
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ age + ph.ecog + strata(inst), lung)
predict(fit,type="expected")
В документе predict.coxph говорится, что ожидаемый тип — это «ожидаемое количество событий с...
1992 просмотров
schedule
13.10.2023
Логранговый тест для определенных групп с помощью регрессии Кокса
У меня есть набор данных выживания. Я хотел бы провести логарифмический тест для лечения, разбитого на 4 категории. Я не могу использовать команду survdiff() , потому что асимптотическое распределение этих статистических данных представляет собой...
681 просмотров
schedule
03.03.2023
ошибка пакета smcure
Я хотел бы выполнить анализ лечения, и когда я запускаю код ниже:
pd <- smcure(Surv(FAILTIME,FAILCENS)~trt+Age1 , cureform =~trt+Age1 ,data=saba, model="ph",nboot=1000)
Об этой ошибке сообщается:
Ошибка в rep(1, n): неверный...
133 просмотров
schedule
14.10.2023
newdata при построении кривой выживаемости регрессии Кокса в r
Я пытаюсь построить скорректированную кривую выживаемости, построив регрессию Кокса при использовании переменных взаимодействий.
читая страницу Survfit.coxph https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survfit.coxph.html я вижу...
1149 просмотров
schedule
05.02.2022
R coxph() с термином взаимодействия, предупреждение: матрица X считается сингулярной
Пожалуйста, будьте терпеливы со мной. Я новичок на этом сайте.
Я моделирую выживание черепашьего гнезда с помощью функции coxph() и столкнулся с запутанной проблемой с термином взаимодействия между видами и клетками гнезда. У меня есть гнезда от...
1252 просмотров
schedule
17.09.2023
coxph: **Ошибка в if (any(infs)) warning(paste(Loglik сходится перед переменной,: отсутствует значение там, где требуется TRUE/FALSE**
Я решаю проблему мультисенсорной атрибуции, используя функцию coxph() . Это большой набор данных с примерно 1 миллионом данных, но в настоящее время я использую подмножество из ~ 100000. Я удалил все недостающие значения из моих данных. я получаю...
2174 просмотров
schedule
30.04.2022
Можно ли определить случайный предел цикла в JAGS?
Я пытаюсь реализовать модель пропорциональных рисков Вейбулла с долей излечения, следуя подходу, изложенному Хуи, Ибрагимом и Синха (1999) - Новая байесовская модель для данных о выживании с долей выживаемости. Однако я не уверен, можно ли определить...
269 просмотров
schedule
28.06.2023
Как создать бинарный предитор из многомерной модели glmnet (coxnet)?
Давайте воспользуемся следующим примером:
генерировать данные о выживании (1000 образцов с 30 переменными)
library(glmnet)
library(survival)
set.seed(10101)
N=1000;p=30
nzc=p/3
x=matrix(rnorm(N*p),N,p)
beta=rnorm(nzc)
fx=x[,seq(nzc)]%*%beta/3...
469 просмотров
schedule
30.05.2022
Прогнозы Коксфа не соответствуют коэффициентам
Добрый день,
Я мог бы опубликовать воспроизводимый код и, конечно же, сделаю это, если все согласятся, что что-то не так, но сейчас я думаю, что мой вопрос довольно прост, и кто-то укажет мне правильный путь.
Я работаю с таким набором данных:...
915 просмотров
schedule
25.11.2023
Отсутствует всплывающая подсказка для geom_line_interactive в ggiraph
Я хотел добавить всплывающую подсказку к ggsurvplot . Я использую ggiraph для отображения графика. Поскольку ggiraph не имеет geom_step_interactive , я манипулирую выводом данных ggsurvplot , чтобы получить значения пошаговой функции, и...
625 просмотров
schedule
18.09.2023
Создать переменную, зависящую от последних и текущих значений переменных наблюдения.
Основываясь на приведенном ниже упрощенном наборе данных, я хотел бы создать новую переменную X3, которая равна 1, если последнее наблюдение by переменная id имеет значение по умолчанию = 1 и если X1 = X2, else X3 = 0.
data example;...
70 просмотров
schedule
19.01.2024
Расчет показателя Бриера и интегрированного показателя Бриера с использованием пакета Ranger R
Я хочу рассчитать оценку Бриера и интегрированную оценку Бриера для моего анализа с использованием R-пакета «рейнджер».
В качестве примера использую данные ветерана из пакета "Survival" следующим образом
install.packages("ranger")...
2483 просмотров
schedule
21.12.2023
