Вопросы по теме 'torque'
Перемещает ли пакетная система PBS несколько последовательных заданий между узлами?
Если мне нужно запустить много последовательных программ «параллельно» (потому что проблема проста, но требует много времени — мне нужно прочитать много разных наборов данных для одной и той же программы), решение будет простым, если я использую...
4195 просмотров
schedule
16.05.2023
Дождитесь завершения всех заданий пользователя перед отправкой последующих заданий в кластер PBS.
Я пытаюсь настроить некоторые bash-скрипты, чтобы они запускались на ( pbs ) кластер.
Отдельные задачи выполняются несколькими сценариями, которые запускаются основным сценарием. Пока что эти основные сценарии запускают несколько сценариев в...
6168 просмотров
schedule
07.12.2022
Крутящий момент PBS_Server
кто-нибудь знает, как получить идентификатор процесса (pid) отправленного задания на вычислительном узле. Мне нужен pid для запуска некоторых скриптов для анализа ресурсов задания.
Я использую Torque версии 4.1.2.
Спасибо!
135 просмотров
schedule
13.06.2022
Как получить информацию о выполненных заданиях PBS или Torque?
У меня есть идентификаторы выполненных работ. Как мне проверить его подробную информацию, такую как время выполнения, выделенные узлы и т. д.? Я помню, что у SGE есть команда для этого (qacct?). Но я не смог найти его для PBS или Torque. Спасибо.
7926 просмотров
schedule
17.08.2023
Настройте кластер крутящего момента / moab для использования нескольких ядер на узел с одним контуром
Это продолжение на [ Как настроить кластер doSNOW и SOCK с планировщиком Torque / MOAB?
У меня есть сценарий с ограничением памяти, который использует только 1 цикл foreach , но я бы хотел, чтобы 2 итерации выполнялись на node1 и 2 итерации...
742 просмотров
schedule
21.12.2022
Torque / OpenMPI динамически выделяет узлы в зависимости от количества процессоров
Мне было интересно, достаточно ли умен Torque, чтобы назначить правильное количество узлов в зависимости от того, сколько ядер MPI вы запрашиваете. Для нашего кластера у нас есть разнородные узлы, и может быть довольно расточительно просто указать...
410 просмотров
schedule
01.01.2022
Как получить прошедшее время кучи заданий PBS Torque?
Я использую PBS Torque для выполнения нескольких заданий. Идея проста: каждое задание работает с фрагментом данных. Скрипт PBS_Torque job_script для запуска задания называется run_appli.sh
Вот простой код (код 1) для запуска 10 заданий
for...
744 просмотров
schedule
13.11.2023
Состояние узла = отключено с TORQUE v6.1.0 на рабочей станции
Я устанавливал Torque 6.1.0 на рабочую станцию Ubuntu 16.04, но установка, похоже, не распознает, сколько ядер и потоков имеет машина. Единственный настроенный мной узел показывал состояние «состояние = не работает», и любое задание вызывало...
3175 просмотров
schedule
14.10.2023
qsub: можно ли использовать оба параметра -k и -o?
Недавно мне пришлось перейти с вычислительного кластера с LSF (bsub) на тот, который использует Torque (qsub).
В предыдущем кластере я смог проверить свои задания на лету с помощью команды bpeek .
На новом кластере эта команда недоступна (ни...
108 просмотров
schedule
02.03.2023
Snakemake --use-conda с --cluster и хранилищем NFS4
Я использую snakemake в режиме кластера, чтобы отправить простой рабочий процесс с одним правилом в HPCC, который запускает Torque с несколькими вычислительными узлами. Хранилище NFSv4 смонтировано в / data. Есть ссылка / PROJECT_DIR - ›/ data /...
63 просмотров
schedule
14.02.2022