При работе с данными филогенетического дерева в R (особенно при работе с объектами "phylo" или "phylo4") было бы полезно нормализовать длину ветвей, чтобы определенные таксоны (те, которые развиваются быстрее) не вносили непропорционально большую длину ветвей. к дереву. Похоже, что это обычное дело при вычислении значений UniFrac, как можно найти в обсуждении здесь: http://bmf2.colorado.edu/unifrac/help.psp. (Однако мне нужно больше, чем просто значения UniFrac).
Однако я не могу найти функцию, которая выполняет этот шаг нормализации. Я искал обезьяны, пиканте, адефило и филобазу. Может ли кто-нибудь направить меня к пакету, который включает эту функцию, или к пакету, который упрощает написание такой функции?
