Пример из документации ?aggregate генерирует ошибку

Почему это не работает для меня:

Я вставил следующий пример из справки R:

aggregate(. ~ Species, data = iris, mean)

Я получаю следующую ошибку каждый раз

Error in m[[2L]][[2L]] <- parse(text = lhs)[[1L]] : 
  object of type 'symbol' is not subsettable

Однако работает следующее:

aggregate(len ~ ., data = ToothGrowth, mean)

Удивлен...

Правки: предоставлена ​​информация о сеансе

> sessionInfo() 
R version 2.12.2 (2011-02-25)
Platform: x86_64-pc-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] splines   stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
 [1] doBy_4.4.0         MASS_7.3-11        snow_0.3-6         lme4_0.999375-39   Matrix_0.999375-46 lattice_0.19-17   
 [7] multcomp_1.2-6     mvtnorm_0.9-96     R2HTML_2.2         survival_2.36-5    reshape_0.8.4      plyr_1.4          
[13] rcom_2.2-3.1       rscproxy_1.3-1     Biostrings_2.18.4  IRanges_1.8.9     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] Biobase_2.10.0 grid_2.12.2    nlme_3.1-98    stats4_2.12.2  tools_2.12.2 

person John Clark    schedule 21.09.2011    source источник
comment
Этот пример работает нормально для меня. Я рекомендую вам попробовать еще раз, возможно, набрав его напрямую (не копировать/вставить), и если это не удастся, попробуйте добавить некоторую информацию о версии R, которую вы используете, и вашей ОС.   -  person joran    schedule 21.09.2011
comment
Код из примера у меня работает. Это наводит меня на мысль, что вы (или загруженный вами пакет) переопределили что-то важное. Пожалуйста, добавьте sessionInfo() к вашему вопросу.   -  person Joshua Ulrich    schedule 21.09.2011
comment
Я не знаком с некоторыми из этих пакетов. Как сказал Джошуа, попробуйте запустить код агрегата() в новом сеансе, загрузив только базовые пакеты. Кроме того, в качестве общей рекомендации я бы предложил обновить R до текущей версии, если это возможно.   -  person joran    schedule 21.09.2011
comment
Я пытался печатать перед публикацией, так как не хотел никого беспокоить. Я использовал Rstudio, теперь я вставил в Rgui, и у меня тоже работает! снова удивлен... есть ли недостатки в использовании Rstudio?? раньше не понимал....   -  person John Clark    schedule 21.09.2011
comment
Я сомневаюсь, что проблема была связана с RStudio (хотя, я полагаю, все возможно). Скорее всего, так и было, как сказал Иисус Навин; вы или пакет переопределили что-то важное.   -  person joran    schedule 21.09.2011
comment
Как удалить, я имею в виду временное, то есть отсоединить, все прикрепленные пакеты? Есть ли какая-нибудь команда для этого?   -  person John Clark    schedule 21.09.2011
comment
Запуск R в режиме --vanilla может быть удобен для решения подобных проблем.   -  person Ben Bolker    schedule 22.09.2011


Ответы (1)


Этот вопрос частично решен. Я использовал новый сеанс R, вставил код и получил то, что хотел. Потенциально пакет или что-то, что я определяю в сеансе, вызывает проблему (я не знаю), как предлагается здесь, см. prov.

person John Clark    schedule 21.09.2011
comment
Предлагаю вам закрыть тогда, это кажется невоспроизводимым. - person smci; 01.11.2011