Вопросы по теме 'pubmed'
Полнотекстовые PDF-файлы для статей PubMed
Во время работы над проектом мне нужно загружать и обрабатывать полнотекстовые статьи для рефератов PubMed, есть ли какой-либо реализованный код или инструмент, который позволяет пользователю вводить набор идентификаторов PubMed и загружать бесплатные...
4401 просмотров
schedule
12.05.2024
Проблема с анализом данных публикации из PubMed с помощью Entrez
Я пытаюсь использовать Entrez для импорта данных публикации в базу данных. Часть поиска работает нормально, но когда я пытаюсь разобрать:
from Bio import Entrez
def create_publication(pmid):
handle = Entrez.efetch("pubmed", id=pmid,...
639 просмотров
schedule
28.12.2023
BioPython напишет программу для запроса PubMed
Я должен запросить у пользователя запрос, а затем распечатать количество совпадений и название, имя первого автора, имя последнего автора для первых 5 возвращенных результатов.
Что у меня есть до сих пор:
from Bio import Entrez
from Bio import...
224 просмотров
schedule
22.05.2023
Извлечение информации о принадлежности из строки поиска PubMed в R
Мне нужна помощь в извлечении информации об аффилиации из строк поиска PubMed в R. Я уже успешно извлек информацию об аффилиации из одного XML-файла идентификатора PubMed, но теперь у меня есть строка поиска из нескольких терминов, из которой мне...
236 просмотров
schedule
18.06.2022
Контроль взрывного роста терминов с помощью Biopython
Мне не удалось найти документацию о том, как контролировать взрыв терминов при проведении поиска Biopython в Medline/PubMed.
Например, если я ищу surgery, oral [MH] в PubMed, он находит 69 926 соответствующих публикаций. (Говорят, что PubMed...
78 просмотров
schedule
07.02.2024
Неполные аффилиации, полученные с помощью pmApiRequest и pmApi2df из pubmedR
При поиске сведений об авторских принадлежностях журнала с помощью pubmedR я вижу, что они иногда неполны. Ниже пример:
library(pubmedR)
journal <- "Advances in Clinical Chemistry[JO] AND 2021:2021[DP]"
article_count <-...
27 просмотров
schedule
07.08.2022