Вопросы по теме 'pubmed'

Полнотекстовые PDF-файлы для статей PubMed
Во время работы над проектом мне нужно загружать и обрабатывать полнотекстовые статьи для рефератов PubMed, есть ли какой-либо реализованный код или инструмент, который позволяет пользователю вводить набор идентификаторов PubMed и загружать бесплатные...
4401 просмотров
schedule 12.05.2024

Проблема с анализом данных публикации из PubMed с помощью Entrez
Я пытаюсь использовать Entrez для импорта данных публикации в базу данных. Часть поиска работает нормально, но когда я пытаюсь разобрать: from Bio import Entrez def create_publication(pmid): handle = Entrez.efetch("pubmed", id=pmid,...
639 просмотров
schedule 28.12.2023

BioPython напишет программу для запроса PubMed
Я должен запросить у пользователя запрос, а затем распечатать количество совпадений и название, имя первого автора, имя последнего автора для первых 5 возвращенных результатов. Что у меня есть до сих пор: from Bio import Entrez from Bio import...
224 просмотров
schedule 22.05.2023

Извлечение информации о принадлежности из строки поиска PubMed в R
Мне нужна помощь в извлечении информации об аффилиации из строк поиска PubMed в R. Я уже успешно извлек информацию об аффилиации из одного XML-файла идентификатора PubMed, но теперь у меня есть строка поиска из нескольких терминов, из которой мне...
236 просмотров
schedule 18.06.2022

Контроль взрывного роста терминов с помощью Biopython
Мне не удалось найти документацию о том, как контролировать взрыв терминов при проведении поиска Biopython в Medline/PubMed. Например, если я ищу surgery, oral [MH] в PubMed, он находит 69 926 соответствующих публикаций. (Говорят, что PubMed...
78 просмотров
schedule 07.02.2024

Неполные аффилиации, полученные с помощью pmApiRequest и pmApi2df из pubmedR
При поиске сведений об авторских принадлежностях журнала с помощью pubmedR я вижу, что они иногда неполны. Ниже пример: library(pubmedR) journal <- "Advances in Clinical Chemistry[JO] AND 2021:2021[DP]" article_count <-...
27 просмотров
schedule 07.08.2022