У меня есть две дендрограммы, которые я хочу сравнить друг с другом, чтобы выяснить, насколько они «похожи». Но я не знаю ни одного метода для этого (не говоря уже о коде для его реализации, скажем, на R). Есть зацепки? ОБНОВЛЕНИЕ (13...

Я сгруппировал некоторые данные в r и построил результаты в виде дендрограммы. Сейчас я пытаюсь выяснить, как я могу изменить цвет меток, чтобы одинаковые метки имели одинаковый цвет. Я получил свою дендрограмму, используя следующий код:...

Я использую пакет Sparcl ( https://cran.r-project.org/web/packages/sparcl/sparcl.pdf ) для построения дендрограмм в R. В моей конкретной задаче я группирую группы по одному критерию и хочу визуализировать, раскрашивая на основе другого критерия (...

Первоначально я пытался добавить горизонтальную цветную боковую полосу к графику дендрограммы (НЕ ко всей тепловой карте), используя color_bars из dendextend. Приведенный ниже код (СПАСИБО за помощь, Тал!) работает очень хорошо. Остается только...

Я пытаюсь извлечь цвета, используемые при кластеризации circlize_dendrogram . Вот примеры кодов: library(magrittr) library(dendextend) cols <- c("#009000", "#FF033E", "#CB410B", "#3B444B", "#007FFF") dend <- iris[1:40,-5] %>% dist...

В следующем примере: hc <- hclust(dist(mtcars)) hcd <- as.dendrogram((hc)) hcut4 <- cutree(hc,h=200) class(hcut4) plot(hcd,ylim=c(190,450)) Я хотел бы добавить метки классов. Я могу сделать: hcd4 <- cut(hcd,h=200)$upper...

Я читаю дерево ( .nex ), преобразую его в класс dendro и рисую, используя ggdendrogram из ggplot2 . Как разместить метки подсказок рядом с подсказками в дендрограмме, а не внизу? mytree <- read.nexus('mytree.nex') den_data_mytree <-...

Я хотел бы создать иерархическое дерево кластеризации относительно большого набора данных (> 3000 наблюдений). К сожалению, из-за включения такого количества меток в конечных узлах дерево выглядит очень загроможденным и содержит много ненужной...