Публикации по теме 'dendrogram'
ИЕРАРХИЧЕСКИЙ КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И ДЕНДОГРАММА
В этой статье я хотел бы поговорить с вами об иерархическом кластерном анализе. Во-первых, давайте обсудим, что такое иерархическая кластеризация и для чего она используется.
ЧТО ТАКОЕ ИЕРАРХИЧЕСКАЯ КЛАСТЕРИЗАЦИЯ?
Иерархический кластерный анализ, который является одним из методов интеллектуального анализа данных, представляет собой процесс разделения данных на кластеры и простого сбора похожих элементов в одной группе. Этот метод максимизирует сходство внутри кластера и минимизирует..
Вопросы по теме 'dendrogram'
Как вы сравниваете сходство двух дендрограмм (на R)?
У меня есть две дендрограммы, которые я хочу сравнить друг с другом, чтобы выяснить, насколько они «похожи». Но я не знаю ни одного метода для этого (не говоря уже о коде для его реализации, скажем, на R).
Есть зацепки?
ОБНОВЛЕНИЕ (13...
12967 просмотров
schedule
10.03.2022
Как мне создать радиальный кластер, как в следующем примере кода на Python?
Я нашел несколько примеров того, как создавать эти точные иерархии (по крайней мере, я считаю, что они есть), как показано ниже здесь stackoverflow.com/questions/2982929/ , которые отлично работают и почти выполняют то, что я ищу.
[РЕДАКТИРОВАТЬ]...
15282 просмотров
schedule
01.03.2022
Альтернативный способ Python найти дендрограмму
У меня есть данные размером 8000x100. Мне нужно сгруппировать эти 8000 элементов. Меня больше интересует порядок этих предметов. Я мог бы получить желаемый результат из приведенного выше кода для небольших данных, но для более высокого размера я...
1902 просмотров
schedule
01.04.2023
ylim in hclust сюжет
У меня есть этот простой код для рисования дендрограммы, но функция ylim , похоже, не работает. Поэтому независимо от того, что я установил, он имеет диапазон y [0,0,5] при рисовании.
Должен ли я использовать другой параметр для установки ylim...
2321 просмотров
schedule
19.09.2023
Как напечатать порядок иерархической кластеризации в R?
Используя следующую матрицу расстояний между 6 итальянскими городами:
0 662 877 255 412 996
662 0 295 468 268 400
877 295 0 754 564 138
255 468 754 0 219 869
412 268 564 219 0 669
996 400 138 869 669 0
Будет ли R выводить порядок, в...
2217 просмотров
schedule
24.02.2023
Красивые дендрограммы в R?
Мои дендрограммы ужасно уродливы, на грани нечитаемости и обычно выглядят так:
library(TraMineR)
library(cluster)
data(biofam)
lab <- c("P","L","M","LM","C","LC","LMC","D")
biofam.seq <- seqdef(biofam[1:500,10:25], states=lab)
ccost...
1619 просмотров
schedule
05.03.2022
Сохранить дендрограмму в формате Newick
Как сохранить дендрограмму, сгенерированную scipy, в формат Newick ?
1925 просмотров
schedule
30.10.2022
Создайте дендрограмму, используя индекс (пропорциональные данные) в качестве группирующей переменной, R
Я хочу создать дендрограмму, используя индекс (пропорциональные данные), который будет показывать похожие кластеры. Я пытаюсь решить, какую метрику расстояния/сходства я должен использовать, чтобы они представляли исходные значения индекса.
У меня...
407 просмотров
schedule
05.04.2023
Как заставить R выводить текстовую информацию об объекте дендрограммы?
Подробнее о тестовых данных и командах, используемых для создания дендрограммы, см. В моем предыдущем вопросе: Использование R для кластеризации на основе евклидова расстояния и полной метрики связи, слишком много векторов?
Вот краткое изложение...
1017 просмотров
schedule
11.05.2022
Как раскрасить одинаковые метки на дендорграмме одним цветом в r
Я сгруппировал некоторые данные в r и построил результаты в виде дендрограммы. Сейчас я пытаюсь выяснить, как я могу изменить цвет меток, чтобы одинаковые метки имели одинаковый цвет.
Я получил свою дендрограмму, используя следующий код:...
437 просмотров
schedule
22.04.2024
Постройте красивые и выровненные цветные дендрограммы в R
Я использую пакет Sparcl ( https://cran.r-project.org/web/packages/sparcl/sparcl.pdf ) для построения дендрограмм в R. В моей конкретной задаче я группирую группы по одному критерию и хочу визуализировать, раскрашивая на основе другого критерия (...
565 просмотров
schedule
07.03.2022
График дендрограммы цветной боковой панели
Первоначально я пытался добавить горизонтальную цветную боковую полосу к графику дендрограммы (НЕ ко всей тепловой карте), используя color_bars из dendextend.
Приведенный ниже код (СПАСИБО за помощь, Тал!) работает очень хорошо. Остается только...
3013 просмотров
schedule
23.11.2023
Раскрасьте галочки на дендрограмме, чтобы они соответствовали цветам кластера.
Как я могу индивидуально раскрасить метки дендрограммы, чтобы они соответствовали цветам кластеров в MATLAB?
Вот пример желаемого вывода, сгенерированного с использованием кода в моем ответе ниже (обратите внимание, что метки представляют собой...
734 просмотров
schedule
23.05.2022
Равномерно разнесенные длины в дендрограммах
На этой диаграмме основная информация (большинство узлов) находится в крайнем левом углу.
Я хочу, чтобы дендрограмму было легко читать, поэтому края должны быть пропорционально длинными. Какие-то конкретные аргументы, которые нужно использовать,...
157 просмотров
schedule
06.08.2023
Scipy дендрограмма с именами
Я использую пример дендрограммы из этот пост в моей работе, но я также хотел бы отслеживать, какая строка / столбец от какой части данных.
Я отредактировал код с записями имен данных как names , как показано ниже, и хотел бы распечатать имена...
1347 просмотров
schedule
05.05.2022
Как я могу скрыть корневой элемент в дендрограмме d3
У меня есть следующий код
var m = [20, this.settings.get("margin_right"), 20, this.settings.get("margin_left")],
w = width - m[1] - m[3],
h = height - m[0] - m[2],
i = 0;
var tree...
205 просмотров
schedule
23.01.2023
Постройте дендрограмму разреза с метками классов
В следующем примере:
hc <- hclust(dist(mtcars))
hcd <- as.dendrogram((hc))
hcut4 <- cutree(hc,h=200)
class(hcut4)
plot(hcd,ylim=c(190,450))
Я хотел бы добавить метки классов. Я могу сделать:
hcd4 <- cut(hcd,h=200)$upper...
944 просмотров
schedule
06.08.2022
Связь между координатами графика дендрограммы и узлами кластера в scipy
Я ищу способ получить координаты точки кластера в дендрограмма на основе его ClusterNode возвращает to_tree .
Использование scipy для построения дендрограммы из таких данных, как:
X = data
Y = pdist(X)
Z = linkage(Y)
dend = dendrogram(Z)...
1407 просмотров
schedule
29.01.2023
Получение ошибки переполнения стека узла при попытке распечатать дендрограмму
Я пытаюсь получить высоту внутренних узлов dendrogram в порядке BFS .
Функция utils::str печатает dendrogram в порядке BFS , поэтому я решил использовать ее (перенаправить вывод в файл и выполнить некоторый анализ, чтобы получить нужную мне...
6531 просмотров
schedule
26.11.2023
rheatmap.2: предотвращение манипулирования некоторыми строками матрицы в дендрограмме
Я анализирую определенные данные по нескольким наблюдениям с несколькими переменными и визуализирую их с помощью тепловых карт, выполняя перестановку строк и столбцов с кластеризацией и построением дендрограммы. Я использую функцию heatmap.2() из...
376 просмотров
schedule
15.09.2022
